Nanofiltratie is een techniek die relatief nieuw is maar de laatste jaren sterk in opkomst is. De techniek van nanofiltratie is vergelijkbaar met die van omgekeerde osmose maar in tegenstelling tot omgekeerde osmose kan nanofiltratie verschillende componenten zoals één en twééwaardige ionen van elkaar onderscheiden. Deze techniek wordt vooral gebruikt om multivalente ionen en kleine organische moleculen uit het water te verwijderen en kan worden toegepast bij ontharding, ontkleuring en verwijdering van pesticiden etc. Het osmotische drukverschil zal veel kleiner zijn dan bij omgekeerde osmose omdat er maar een gedeelte van de opgeloste zouten wordt tegengehouden en daarom kan er in het algemeen gewerkt worden met lagere drukken.